事前にCalibreのインストールが必要(参考: eBook and PDF · HonKit Documentation

$ git clone https://github.com/asciidwango/js-primer.git
$ cd js-primer
$ npm install honkit --save-dev
$ npx honkit epub ./ ~/tmp/jsprimer.epub

カバー画像がある場合、cover.jpgをルートディレクトリ(source)に置いておく。